La Guardia Costiera Ausiliaria opera nel prestare la propria attività negli interventi relativi a emergenze in ausilio al Dipartimento di Protezione Civile e alla Guardia Costiera intervenendo con il proprio personale sia in mare, sia sulla terraferma. L'organizzazione è inserita nella Colonna Mobile Nazionale di Protezione Civile ed in quelle delle Regioni in cui operano i Centri Territoriali.